钱伟长讲坛第69讲:《大分子和凝聚态系统的量子分块方法新进展》

2023.10.10

投稿:刘佳部门:钱伟长学院浏览次数:

活动信息

报告主题:《大分子和凝聚态系统的量子分块方法新进展》

报告人:何晓 教授

报告时间:2023年10月12日周四18:00

报告地点:宝山校区J楼202方润华讲堂

报告人简介:何晓,华东师范大学,化学与分子工程学院教授,博士生导师。2003和2006年分别在南京大学获得学士和硕士学位;2010年在美国佛罗里达大学获得博士学位;2011-2012年在美国伊利诺伊大学香槟分校从事博士后研究。研究领域为理论与计算化学,研究方向包括复杂分子体系的量子分块方法,密度泛函方法的发展,主要应用于生物大分子和凝聚态体系的第一性原理分子动力学模拟,药物设计和生物酶分子设计。在Nat. Comput. Sci.(1)、PNAS(3)、Nat. Commun.(2)、J. Am. Chem. Soc.(6)、Angew. Chem. Int. Ed.(10)、Acc. Chem. Res.(2)、Cell Research(1)、Chem. Sci.(2)、WIRES Comput. Mol. Sci.(1),J. Chem. Theory Comput.(14),J. Chem. Phys.(10)等重要学术期刊发表SCI论文150余篇,总被引5000余次,4篇文章入选全球ESI 1%高被引论文。曾获得国家高层次人才计划、国家优秀青年科学基金项目、中国化学会唐敖庆理论化学青年奖。现任中国化学会计算(机)化学专业委员会委员,中国生物信息学会生物信息与药物发现专业委员会委员,中国化学会理论化学青年委员会委员,J. Chem. Inf. Model.期刊的顾问编委。

报告摘要:传统从头算方法的主要计算限制是缩放问题,因为从头算的计算成本随着系统规模的增加而增加。在过去的二十年中,碎片化方法为量子力学方法的发展及其在大分子中的应用打开了一扇新的大门。在这次演讲中,我将介绍我们最近为生物分子系统的QM应用开发的带有共轭帽的静电嵌入广义分子分步(EE-GMFCC)方法。通过在每个片段计算中引入静电嵌入场,并降低远程两体QM相互作用的计算成本,EE-GMFCC方法能够准确地再现蛋白质全系统QM计算的分子性质(如偶极矩、电子密度和静电势)、总能量和静电溶剂化能。EE-GMFCC方法已被应用于蛋白质结构优化、振动谱计算、蛋白质-配体结合亲和预测、蛋白质NMR化学位移计算、大型体系从头算分子动力学模拟等领域。

欢迎学校广大师生共同聆听此次讲座!